"SK 순자산 100조 시총은 25조"...할인율 75% vs 53% 차이 왜?

행동주의펀드 얼라인, 뉴욕 투자자 행사서 SK㈜ 지분 1.5% 공개"내재 NAV 할인율 75%"...증권가 추정과 20%p 차이 '왜'SK스퀘어 할인 반영 여부가 갈라...밸류업 플랜에 '할인율' 목표 담아야 등록 2026-10-25 오후 1:43:17 수정 2026-10-25 오후 1:43:17 가 가 [이데일리 김경은 기자] 행동주의 펀드 얼라인파트너스자산운용(얼라인)이 SK㈜ 지분 1.5%를 보유한 사실을 공개하며 SK그룹의 ‘이중 지주사 할인’ 문제를 정조준했다. 얼라인이 평가한 SK㈜의 내재 순자산가치(NAV)는 약 100조원으로, 현재 주가는 이보다 75% 할인된 수준이다. 통상적인 지주사 할인율인 50~60%를 크게 웃돈다. 이같은 차이는 SK㈜가 SK스퀘어를 통해 SK하이닉스를 간접 보유하면서 핵심 자산의 가치가 두 단계에 걸쳐 할인되는 지배구조에 있다는 주장이다. SK스퀘어 지분 평가 방식이 차이 만들어 25일 금융투자업계에 따르면 이창환 얼라인 대표는 지난 20일(현지시간) 미국 뉴욕에서 열린 ‘13D 모니터 액티브-패시브 투자자 서밋’에서 SK㈜를 투자 아이디어로 소개했다. 얼라인이 운용·자문하는 펀드는 SK㈜ 주식 108만8753주(1.50%)를 보유하고 있다. 얼라인이 산출한 SK㈜의 내재 순자산가치(NAV)는 99조5000억원이다. 지난 16일 기준 자사주를 제외한 시가총액은 24조9000억원으로, 할인율은 75.0%에 달한다. 또 2027년 예상 순이익 기준 주가수익비율(PER)는 1.0배로 코스피200 중 최하위라고 분석했다. 증권가에서 제시되는 지주사 할인율을 월등히 뛰어넘는 이 수치가 나온 배경을 보려면 증권사의 산정 방식과 비교해야한다. 키움증권은 지난달 보고서에서 SK㈜의 NAV를 70조3000억원, 할인율을 53%로 계산했다. 두 수치를 가른 핵심은 중간 지주회사인 SK스퀘어를 평가하는 방식이다. SK㈜는 SK스퀘어 지분 32.2%를, SK스퀘어는 SK하이닉스 지분 20.0%를 보유하고 있다. 증권가는 통상 SK스퀘어 지분을 시장 가격으로 반영한다. 키움증권이 NAV에 넣은 SK스퀘어 지분가치 역시 42조5000억원이었다. 얼라인은 SK스퀘어 주가에 적용된 할인을 걷어냈다. SK㈜가 SK스퀘어를 통해 간접 보유한 SK하이닉스 실질지분 6.5%(32.2%×20.0%)의 시장가치 59조9000억원을 그대로 반영했다. NAV 차이의 상당 부분이 SK스퀘어 단계의 할인 인정 여부에...